L'une des questions les plus fréquentes et les plus légitimes qui se posent avant tout type de thérapie est celle des effets secondaires qu'elle a sur notre corps. Est-ce que ça fera mal? Y aura-t-il des risques?
Si nous prenions la notice d'un médicament (par exemple un analgésique très courant que nous utilisons contre un simple mal de tête) et commencions à lire ses contre-indications, nous pourrions lire une liste assez terrifiante d'effets secondaires que le médicament pourrait avoir: insuffisance hépatique, insuffisance rénale, insuffisance cardiaque, ulcère, etc.

Actuellement, les études cliniques et scientifiques réalisées montrent que la magnétothérapie n'a aucun effet secondaire (ou contre-indication). C'est très important car cela confirme que la magnétothérapie aide notre corps d'une manière naturelle, ou mieux: elle aide les cellules de notre corps à faire ce qu'elles font déjà naturellement, favorisant la régénération et la vascularisation des tissus et soulageant la douleur.
Ce n'est pas un miracle, et bien sûr, il faut donner le temps à la thérapie d'avoir ses effets. Mais il est scientifiquement prouvé que la thérapie par champs électromagnétiques est efficace pour le traitement de certaines maladies et de la douleur et qu'elle agit naturellement, ce que nous ne pouvons pas dire des médicaments. 

Il y a, cependant, quelques cas et situations spécifiques dans lesquels il n'est pas recommandé de l'utiliser:
Chez les patients porteurs d'un stimulateur cardiaque: en théorie, le stimulateur cardiaque devrait être immunisé contre les champs magnétiques avec lesquels notre corps entre en contact, mais pourquoi le risquer?
Chez la femme enceinte : évidemment, aucune expérience n'a été menée sur les effets de la magnétothérapie sur le fœtus.
Chez les patients hypertendus et cardiopathes
Chez les épileptiques
Chez les enfants, à moins qu'un médecin n'ait été consulté
Dans les zones tumorales
Sur les yeux
Sur le sinus carotidien

Cependant, je voudrais souligner qu'il s'agit d'avertissements et non d'effets secondaires qui ne sont pas comparables à ceux que nous lisons (ou ne lisons pas) sur la notice des médicaments que nous prenons plus ou moins quotidiennement et souvent trop légèrement.